الحجر الجيري للمياه العذبة عادة ما يكون ميكرريت. تعتبر أحافير charophyte (stonewort)، وهي شكل من أشكال الطحالب الخضراء في المياه العذبة، من سمات هذه البيئات، حيث تنتج نباتات الفحم الكربونات وتصيدها. [24] قد يتشكل الحجر الجيري أيضًا في متبخر بيئات رسوبية. [25] [26] الكالسيت هو أحد المعادن الأولى التي تترسب في المتبخرات البحرية. [27]